幻塔深海基地2是游戏中较为困难的关卡之一，该关卡奖励丰厚，可以获得大量武器和资源装备，但在通关之前需要面对多个挑战。 第一关比较简单，只需要面对几个近战小兵就可以轻松通过。

 

通过后领取宝箱，并且需要一个队友通关激光阻拦，才能开启通向下一关的通道。 第二关会出现水域，而玩家需要站在三个台子上避免被淹没。此时BOSS雷翼会放出闪电同时击打两个台子，注意躲避。当水域消失时，玩家可以继续击杀小兵直到BOSS出现。 第三关的BOSS是吞噬者，是一只大蛤蟆，虽然行动缓慢，但攻击力很高。玩家需要提高警惕，尽量避免受到技能攻击。 BOSS的一个技能是放出海水将台面淹没，此时玩家可以换上源器——喷气滑板来轻松躲避水龙卷，从而避免被秒杀。